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建行短信服务费的扣除方式如下。
1、从银行卡余额里面扣费，银行卡的短信服务费是银行的一项收费项目，一般会在用户开卡时自动开通，并从银行卡余额中扣除，具体的扣费时间和扣费金额会在办卡时与银行客服协商确定，如果中途取消短信通知服务，已扣除的费用不会退还，如果用户没有取消短信服务，银行会按月正常收取费用。
2、如果银行卡余额不足，长期欠费的话，银行会发短信或电话催缴欠费，如果账户为零或长时间未补足欠款，银行会自动停止短信服务并且转为人工通知欠费情况，用户需要确保银行卡余额充足以支付短信服务费，否则，服务费会从银行卡签约的关联公司账户中直接扣除，如果账户余额不足以支付费用，银行会收取逾期费用，用户还可以选择通过自助渠道关闭短信服务通知功能来停止扣费，一旦用户取消了短信通知服务，银行将不再收取相关费用，不过，用户仍需承担其他相关费用如年费和小额管理费等。
建行短信服务费会从银行卡余额中扣除或关联公司账户中直接扣除，用户可以根据自身情况选择自助渠道关闭短信服务通知功能来停止扣费，以上内容仅供参考，如有疑问请咨询建设银行客服获取更多详细信息。